Avec plus de 40 millions de citations, PubMed peut rapidement devenir difficile à utiliser. Voici la méthode que j’utilise pour transformer plusieurs milliers de résultats en une sélection d’articles réellement pertinents.

Introduction

PubMed est probablement la base de données médicale la plus utilisée au monde. Elle contient aujourd’hui plus de 40 millions de citations d’articles scientifiques.

Face à un tel volume d’informations, il est facile de se sentir perdu. Une recherche mal construite peut générer plusieurs milliers, voire plusieurs dizaines de milliers de résultats. À l’inverse, une recherche bien menée permet d’identifier rapidement les articles les plus pertinents.

Contrairement à une idée reçue, une recherche efficace sur PubMed ne commence pas par la saisie de mots-clés dans la barre de recherche. Elle commence par une réflexion sur ce que l’on cherche réellement.

Voici la méthode que j’utilise lorsque je dois explorer un sujet scientifique ou médical.

Avant d’ouvrir PubMed : définir sa question

La première étape consiste à clarifier la question que l’on souhaite explorer.

Cherche-t-on :

• les travaux publiés par un auteur particulier ?
• les dernières avancées dans un domaine ?
• des données sur un traitement spécifique ?
• une définition ou un état des connaissances sur un sujet ?

Il est également utile de réfléchir au type d’articles recherchés :

• études cliniques ;
• revues de la littérature ;
• revues systématiques ;
• méta-analyses.

Plus la question est précise, plus la recherche sera efficace.

Vérifier la terminologie utilisée dans le domaine

Avant même d’ouvrir PubMed, je passe souvent quelques minutes à vérifier que j’utilise les bons termes.

Lorsque je découvre un nouveau sujet, je commence généralement par une recherche rapide sur Internet afin de comprendre comment les chercheurs et les cliniciens désignent réellement le concept qui m’intéresse.

Cette étape peut sembler anodine, mais elle évite de passer à côté d’articles importants simplement parce que les mauvais mots-clés ont été utilisés.

Comment effectuer une première recherche sur PubMed ?

Une fois la question clarifiée et les mots-clés identifiés, il est temps d’ouvrir PubMed.

Prenons un exemple simple.

Imaginons que nous souhaitions explorer les effets de la chaleur sur le corps humain.

Une première recherche pourrait utiliser les termes :

Body heat human

Cette requête retourne plus de 19 000 résultats.

À ce stade, je ne regarde généralement aucun article.

Cela peut sembler contre-intuitif, mais lorsque plusieurs milliers de résultats sont affichés, les premiers articles ne sont pas forcément représentatifs de l’ensemble de la littérature disponible.

Mon objectif est d’abord de réduire le volume de résultats.

Comment utiliser les filtres PubMed pour réduire les résultats ?

Les filtres constituent l’un des outils les plus utiles de PubMed.

Je ne les utilise pas tous. Leur utilisation dépend de la question étudiée.

Dans le cadre d’une recherche exploratoire, mes premiers filtres sont souvent :

• Review ;
• Systematic Review ;
• Meta-Analysis ;
• Langue (anglais ou français).

Dans notre exemple, l’application de ces filtres permet de réduire considérablement le nombre de résultats.

Faut-il commencer par les reviews sur PubMed ?

Lorsque je découvre un sujet, je cherche généralement à comprendre rapidement les bases du domaine.

C’est pourquoi je commence souvent par les reviews.

Les revues de la littérature permettent généralement :

• d’obtenir des définitions utiles ;
• de comprendre les concepts importants ;
• d’identifier les études qui ont marqué le domaine ;
• de repérer les questions encore débattues.

Avant de lire des dizaines d’études individuelles, les reviews permettent souvent d’acquérir une vision d’ensemble beaucoup plus rapidement.

Comment afficher les résumés des articles sur PubMed ?

Lorsque le nombre de résultats devient raisonnable, j’utilise généralement le mode d’affichage « Abstract ».

Cette présentation permet de visualiser immédiatement le résumé des articles sans devoir ouvrir chaque référence individuellement.

Pour une première sélection, c’est un gain de temps considérable.

Comment sélectionner les articles pertinents sur PubMed ?

À ce stade, je garde toujours en tête la question initiale.

Je parcours les titres et les abstracts à la recherche d’éléments qui répondent directement à cette question.

Lorsque je trouve un article intéressant, je conserve sa référence.

Selon le contexte, cela peut être :

• l’ajout dans Zotero ;
• la conservation du PMID ;
• l’enregistrement de la citation.

L’objectif n’est pas de tout lire immédiatement, mais de constituer progressivement une liste d’articles pertinents.

Conclusion

Une recherche efficace sur PubMed ne consiste pas à parcourir des milliers d’articles.

Elle consiste à partir d’une question claire, utiliser la bonne terminologie, réduire progressivement le nombre de résultats et conserver uniquement les références pertinentes.

PubMed est un outil extrêmement puissant, mais sa véritable difficulté n’est pas son utilisation technique. Elle réside dans la capacité à formuler correctement sa question et à sélectionner les articles les plus utiles.